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饒毅:美妙的生物熒光分子與好奇的生物化學(xué)家

發(fā)布時間:2020-06-10 來源: 幽默笑話 點擊:

  

  做出應(yīng)獲諾貝爾獎工作的科學(xué)家,幾十年默默無聞;

  被廣泛應(yīng)用的分子,很少人知其發(fā)現(xiàn)者;

  原始論文鮮為人知,后繼論文倒很熱門;

  曾失明的人,發(fā)現(xiàn)了美麗的發(fā)光蛋白;

  低調(diào)的父親,出了高調(diào)的兒子。

  

  這里簡介一項生物化學(xué)研究,講一個科學(xué)家的故事,還討論一個問題:是否活著的科學(xué)家中還有因好奇而做科學(xué)研究?

  本文和我2002年一篇文章相同,不是預(yù)測諾貝爾獎,而是介紹值得獲獎的工作。名單上不包括可以獲獎、但其工作不值得獲獎?wù)。相反,本文的主人公可能被埋沒得不到獎,但他的工作很值得介紹。

  

  生物發(fā)光和熒光蛋白

  

  現(xiàn)在研究生物的人,幾乎都知道綠色熒光蛋白(GFP),但常常不知或搞錯其發(fā)現(xiàn)者。毫無爭議的發(fā)現(xiàn)者是日裔美國科學(xué)家下村修(Osamu Shimomura,下村脩)和已故美國科學(xué)家約翰森(Frank H. Johnson)。他們1961到1974年發(fā)現(xiàn)兩種發(fā)光的蛋白質(zhì):水母素(aequorin)和GFP。

  生物發(fā)光現(xiàn)象,下村修和約翰森之前就有人研究。螢火蟲發(fā)熒光,是由熒光酶(luciferase)作為酶催化底物分子熒光素(luciferin),有化學(xué)反應(yīng)如氧化,以后產(chǎn)生熒光。而發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)本身發(fā)光,無需底物,起源于下村修和約翰森的研究。

  下村修和約翰森用過幾種實驗動物,和本故事相關(guān)的是學(xué)名為Aequorea victoria的水母。1962年,下村修和約翰森等在《細胞和比較生理學(xué)雜志》上報道,他們分離純化了水母中發(fā)光蛋白水母素。據(jù)說下村修用水母提取發(fā)光蛋白時,有天下班要回家了,他把產(chǎn)物倒進水池里,臨出門前關(guān)燈后,回頭看一眼水池,結(jié)果見水池閃閃發(fā)光。因為養(yǎng)魚缸的水也流到同一水池,他懷疑是魚缸排出的成分影響水母素,不久他就確定鈣離子增強水母素發(fā)光。1963年,他們在《科學(xué)》雜志報道鈣和水母素發(fā)光的關(guān)系。1967年Ridgway和Ashley提出檢測鈣的新方法:用水母素。鈣離子是生物體內(nèi)的重要信號分子,水母素成為第一個有空間分辨能力的鈣檢測方法,是目前仍用的方法之一。

  1955年Davenport和Nicol發(fā)現(xiàn)水母可以發(fā)綠光,但不知其因。1962年下村修和約翰森那篇純化水母素的文章中,有個注腳,說還發(fā)現(xiàn)了另一種蛋白,它在陽光下呈綠色、鎢絲下呈黃色、紫外光下發(fā)強烈綠色。其后他們仔細研究了其發(fā)光特性。1974年,他們得到了這個蛋白,當(dāng)時稱綠色蛋白、以后稱綠色熒光蛋白(GFP)。Morin和Hastings提出水母素和GFP之間可以發(fā)生能量轉(zhuǎn)移。水母素在鈣刺激下發(fā)光,其能量可轉(zhuǎn)移到GFP,刺激GFP發(fā)光。這是物理化學(xué)中已知的熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)在生物中的發(fā)現(xiàn)。

  下村修本人對GFP的應(yīng)用前景不敏感,也未意識到應(yīng)用的重要性。他離開普林斯頓到Woods Hole海洋研究所后,他的同事普瑞舍(Douglas Prasher)非常感興趣用熒光蛋白做生物示蹤分子。1985年普瑞舍和日裔科學(xué)家Satoshi Inouye分別根據(jù)蛋白質(zhì)序列拿到了水母素的基因(生物學(xué)上準(zhǔn)確地說是cDNA)。1992年,普瑞舍又拿到GFP的基因。有了cDNA,一般生物學(xué)研究者就很容易應(yīng)用,比用蛋白質(zhì)方便多了。

  普瑞舍1992年發(fā)表GFP基因的文章后,離開科學(xué)界。原因是他申請美國國家科學(xué)基金時,評審者說沒有蛋白質(zhì)發(fā)光的先例,就是他找到了這種蛋白,也沒什么價值。一氣之下,他離開學(xué)術(shù)界去麻省空軍國民衛(wèi)隊基地,到農(nóng)業(yè)部動植物服務(wù)部工作。當(dāng)時他如果花幾美元,就可以做一個一般研究生都能做,但非常漂亮的工作:將來自水母的GFP基因放到其他生物體內(nèi)(如細菌),看到熒光,可以很強烈地提示GFP本身可以發(fā)光,無需其他底物、或者輔助分子,也表明可以廣泛用GFP。

  將GFP表達到其他生物體這項工作,1994年由兩個實驗室獨立進行:美國哥倫比亞大學(xué)做線蟲的Marty Chalfie實驗室,和加州大學(xué)圣迭哥分校、Scripps海洋研究所的兩位日裔科學(xué)家Inouye和Tsuji。

  水母素和GFP都有重要的應(yīng)用。但水母素仍是熒光酶的一種,它需熒光素。而GFP是蛋白質(zhì)本身發(fā)光,原理上不同。

  Chalfie的文章立即引起轟動,很多生物學(xué)研究者接著紛紛將GFP引入自己的系統(tǒng)。當(dāng)時好些《自然》、《科學(xué)》文章,證明那里表達GFP,那里就有綠光,這些后續(xù)文章不過是跟風(fēng),上了《自然》也不證明有原創(chuàng)性。

  1994年,華裔美國科學(xué)家錢永。≧oger Y Tsien)開始改造GFP,有多項發(fā)現(xiàn)。世界上目前使用的熒光蛋白大多是錢永健實驗室改造后的變種,有的熒光更強,有的呈黃色、藍色,有的可激活、可變色。用一些不常用做研究樣本的生物找有顏色的蛋白成為一些人的愛好。不過真發(fā)現(xiàn)的有用東西并不很多。成功的例子有俄國科學(xué)院生物有機化學(xué)研究所Sergey A. Lukyanov實驗室從珊瑚里發(fā)現(xiàn)的其他熒光蛋白(FP),包括紅色熒光蛋白。

  綜觀整個過程,從1961年到1974年,下村修和約翰森的研究遙遙領(lǐng)先,但很少人注意。單純從技術(shù)上,其他生化學(xué)家也可以得到水母素和GFP,但需要有想法或興趣。在1974年以后,特別是八十年代后,很多后續(xù)工作顯而易見,一般研究生可以做。其中例外是錢永健實驗室發(fā)現(xiàn)變種出現(xiàn)新顏色,這一發(fā)現(xiàn)出乎意料。

  

  GFP之美麗和妙用

  

  GFP及其衍生物(各種熒光蛋白),絢麗多彩,非常漂亮。

  有些熒光蛋白當(dāng)濃度足夠高時,在日光下可以看到顏色。所以實驗室產(chǎn)生了人為可控制顏色的魚、老鼠。

  熒光蛋白廣泛應(yīng)用于生物學(xué)研究。可以通過常規(guī)的基因操縱手段,將熒光蛋白用來標(biāo)記其他目標(biāo)蛋白,這樣可以觀察、跟蹤目標(biāo)蛋白的時間、空間變化。提供了以前不能達到的時間和空間分辨率,而且可以在活細胞、甚至活體動物中觀察到一些分子。熒光蛋白技術(shù)也使得人們可以研究某些分子的活性,而不僅僅是其存在與否。

  對于有些研究來說,熒光蛋白的作用可以形容為“起死回生”:原來有些方法,需要把生物變成死物才能研究一些現(xiàn)象和過程,而熒光蛋白為主要支柱之一的現(xiàn)代成像技術(shù),使科學(xué)家在活的細胞中觀察和研究這些過程,使一部分“死物學(xué)”變成“生物學(xué)”。

  

  為了好奇

  

  下村修1928年生于京都,長于長崎。1945年他16歲時,原子彈在他故鄉(xiāng)爆炸,他曾失明數(shù)周。1951年,他畢業(yè)于長崎醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)專門部,1960年獲名古屋大學(xué)有機化學(xué)博士。1960年他到美國普林斯頓大學(xué)約翰森實驗室做博士后,63年至65年回日本名古屋大學(xué)任副教授,65年回普林斯頓繼續(xù)在約翰森實驗室,直到1980年。估計是約翰森退休后下村修不能待在普林斯頓了,所以1980至2001年他到麻省Woods Hole海洋生物學(xué)研究所工作、并有波士頓大學(xué)兼職教授之軟差。

  下村修1961年33歲做出重要發(fā)現(xiàn)(1962年發(fā)表),到1974年46歲時,全部關(guān)鍵實驗完成。但到80歲的今年,他幾乎是默默無聞。他多年沒有實驗室,在約翰森實驗室做了近20年博士后,不是為了功。他也沒有當(dāng)選美國科學(xué)院院士,不是為了名。GFP后來帶來了相當(dāng)?shù)氖找,但下村修沒得,也不是為了利。

  下村修加入生物發(fā)光研究是1955年在日本做研究生時,導(dǎo)師讓他到另外一個實驗室去開闊眼界,而那個實驗室的導(dǎo)師介紹他做熒光素。1959年導(dǎo)師逝于癌癥,1960年他到約翰森實驗室。約翰森給他看水母發(fā)光,要他做,可是第一次演示根本沒有發(fā)光。但下村修被約翰森感染了,決定做這個課題。1961年約翰森開了七天的車、每天12小時,帶下村修橫跨美國到西海岸華盛頓州的“星期五港”(Friday Harbor)實驗室,那里當(dāng)時盛產(chǎn)水母,有很多原料,他們在1961年夏做出主要發(fā)現(xiàn)。

  下村修開始做研究時不知其重要性,只是對生物發(fā)光好奇。發(fā)光的生物學(xué)意義,至今尚不清楚;
而發(fā)光蛋白應(yīng)用的重要性,下村修不僅當(dāng)時不知道,而且以后相當(dāng)時間不清楚。水母素應(yīng)用于檢測鈣,是1967年由Ridgway和Ashley提出。最初下村修和約翰森只為提取水母素,而GFP是副產(chǎn)物,F(xiàn)在,這個副產(chǎn)物的用途比原來的正產(chǎn)物還大。GFP作為示蹤蛋白是普瑞舍極力鼓吹。廣泛應(yīng)用在1994年以后。從1974年獲得GFP到1994年,下村修并未大力推動GFP的應(yīng)用。

  下村修樂于做這項工作,只需很基本的條件。2001年退休后,他繼續(xù)做研究,把家里的地下室作為“光蛋白實驗室”,今年80歲的他,還用家庭地址發(fā)表文章。

  

  科學(xué)界并不公平

  

  下村修有非常重要的科學(xué)貢獻。但是科學(xué)界多半不知道他,只知道后續(xù)工作,社會的認可就更少。

  在普林斯頓,他二十年沒有獨立實驗室,在別人領(lǐng)導(dǎo)下工作。到Woods Hole后,是很小的幾人小組。他80歲了,也沒有當(dāng)選哪里的院士。最近幾年開始獲些不知名的獎。非常熱衷于國民獲諾貝爾獎的日本,到近年才有少數(shù)專家知道下村修。

  下村修和遺傳學(xué)家Barbara McClintock不同。她在81歲因為發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)座子獲諾貝爾獎。但慢的主要原因是學(xué)術(shù),而對她個人很早就認可(因為在遺傳學(xué)的多個貢獻,1944年她42歲時當(dāng)選美國科學(xué)院院士,是最年輕的院士之一;
43歲當(dāng)選美國遺傳學(xué)會主席)。1950年代,她提出轉(zhuǎn)座是調(diào)控基因表達的重要機理,但轉(zhuǎn)座調(diào)控基因并不是普遍規(guī)律。她在植物中發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)座現(xiàn)象,不是爭議焦點,一旦大家意識到轉(zhuǎn)座是普遍現(xiàn)象(包括動物)后,就接受了其重要性。而下村修的成果人們用了很多年,沒有爭議,只是大多數(shù)人不知道他的個人貢獻。

  下村修雖然做了非常原創(chuàng)性的工作,很多人用他發(fā)現(xiàn)的GFP,有些生物學(xué)雜志每期都有文章用GFP,有些生物雜志每期20%的文章用了GFP,但絕大多數(shù)人并不知道發(fā)現(xiàn)者是下村修。下村修和約翰森1962年發(fā)現(xiàn)水母素的文章迄今被377次引用,1974年純化GFP的文章被引用169次,Chalfie等1994年《科學(xué)》文章被引用3349次,Inouye 和Tsuji的1994年文章被引用256次。說明大多數(shù)科學(xué)工作者并不知道所用的東西怎么來的。所以,簡單重視引用率也不能代替對領(lǐng)域的真正了解。

  不僅下村修沒有被廣泛認可,其他一些人也遭忽略。1990年,他的合作者約翰森82歲去世時,《紐約時報》的悼文沒有提GFP。普瑞舍拿到GFP基因但缺經(jīng)費。Chalfie文章引用率高但專利搞砸了沒多少收益。

  我2002年寫的值得獲諾貝爾獎名單中,有普瑞舍和錢永健,無下村修。近年我才給學(xué)生講下村修的工作。本文也算是一個更正。

  這個領(lǐng)域,最重要的工作顯然是下村修和約翰森做的。錢永健在兩個方面做出了重要的貢獻,如果錢與下村修合得獎也很合理。第三重要的是普瑞舍。他承前啟后,有助于推廣應(yīng)用下村修的發(fā)現(xiàn)。

  

  錢永健的貢獻

  

  錢永健是取得重要成就的科學(xué)家。他在成像技術(shù)中,有兩項重要工作都與下村修有一定關(guān)系。

  一項是鈣染料。1980年錢永健發(fā)明檢測鈣離子濃度的染料分子,1981年改進將染料引入細胞的方法,以后發(fā)明更多、更好的染料,被廣泛應(yīng)用。檢測鈣的方法有三種:選擇性電極、水母素、鈣染料。在錢永健的鈣染料沒有出現(xiàn)以前,具有空間檢測能力的只有水母素,但當(dāng)時水母素需要注射到細胞內(nèi),應(yīng)用不方便,而錢永健的染料可以通透到細胞里面去。水母素和鈣染料各有優(yōu)缺點,目前用染料的人多。錢永健還發(fā)明了多種染料用于研究其他分子。

  錢永健的第二項工作是GFP。1994年起,錢永健開始研究GFP,改進GFP的發(fā)光強度,發(fā)光顏色(發(fā)明變種,多種不同顏色),發(fā)明更多應(yīng)用方法,闡明發(fā)光原理。世界上應(yīng)用的FP,多半是他發(fā)明的變種。他的專利有很多人用,有公司銷售。

  錢永健的工作,從八十年代一開始就引人矚目。他可能是世界上被邀請給學(xué)術(shù)報告最多的科學(xué)家,因為化學(xué)和生物界都愛聽他的報告,既有技術(shù)應(yīng)用、也有一些很有趣的現(xiàn)象。他1952年出生,年齡允許他等些年(而下村修沒有這個優(yōu)勢)。所以,很多人多年認為錢永健會得諾貝爾獎,可以是化學(xué)、也可以是生理獎。值得指出,錢永健非?隙ㄏ麓逍薜墓ぷ,錢較早公開介紹下村修的發(fā)現(xiàn)。

  錢永健是錢學(xué)森的堂侄。他家多科學(xué)家和工程師。他中學(xué)時獲得過西屋天才獎第一名,大學(xué)在哈佛念化學(xué)和物理,20歲畢業(yè),后獲英國劍橋大學(xué)生理學(xué)博士。他哥哥錢永佑(Richard W Tsien)是神經(jīng)生物學(xué)家,(點擊此處閱讀下一頁)

  曾任Stanford大學(xué)生理系主任。兩兄弟分別獲Rhodes和Marshall學(xué)者獎(通常認為是美國大學(xué)生競爭性最強的兩個獎學(xué)金,克林頓總統(tǒng)曾獲Rhodes),到英國留學(xué),九十年代雙雙成為美國科學(xué)院院士。錢學(xué)森回國后,國內(nèi)教育體系在他的子女應(yīng)該上大學(xué)時受到極大破壞,使錢的子女錢永剛、錢永真沒有得到他們堂兄弟那樣的發(fā)展環(huán)境。錢永剛出生于1948年,文革后才念大學(xué)。但愿錢永健在錢學(xué)森先生在世的時候獲獎,告慰他們?nèi)摇?/p>

  我在華盛頓大學(xué)有位同事,在神經(jīng)生物學(xué)和現(xiàn)代成像都用重要發(fā)現(xiàn)和發(fā)明,他要求很高,批判性很強,公開發(fā)表文章批熱門的領(lǐng)域、批很多人研究不解決問題。他也看不起一些諾貝爾獎得主。有一年剛宣布得獎名單,我到他辦公室去聊天,他沒等我開口,就說:“今天是不幸的一天”。他認為那些人沒一個值得得獎。這位批判性很強的人,卻非常佩服錢永健。

  

  科學(xué)界還會有下村修嗎?

  

  這個問題可以分幾個方面討論。

  當(dāng)然可以問是否現(xiàn)代科學(xué)工作者,比較功利,能否象他那樣抱著一個不知道重要性的東西,不追求資源、不追求認可,持之以恒,自得其樂。

  然后也可以問,如果碰到這樣的人,誰會支持他?下村修和錢永健相差很大。錢永健是人們很快就知道有聰明資質(zhì)的天才,支持他的人很多,他的工作出來馬上為人所知。下村修基本是反例。沒人認為他是天才,他不知道自己工作的重要性,別人也不容易在早期判斷他的工作。普林斯頓就沒有重視他,否則不會在約翰森退休后,讓他走。實際上,當(dāng)時的校長不僅不重視他,也不重視生物,當(dāng)時一批普林斯頓的生物教授因此跑到舊金山加州大學(xué)。斯坦福和哈佛很會靠自己的名聲和經(jīng)費實力招已經(jīng)做出了可以得獎工作的人,但沒有發(fā)現(xiàn)下村修。

  只有少數(shù)人會欣賞下村修,支持他做些事。如果要委員會投票表決是否支持他,大概多數(shù)委員會難以讓他過關(guān)。但在科學(xué)界,需要有些人、有些機構(gòu)、有些時候敢于承擔(dān)風(fēng)險,支持少數(shù)下村修這樣的科學(xué)家,做些開始看來稀奇古怪、不著邊際的工作。成本其實相當(dāng)?shù),主要是支持者不怕其他人的批評。其中多數(shù)這種人最后沒什么結(jié)果,但是只要很少一些支持對了,對科學(xué)界的作用可以很大。

  對于學(xué)生來說,趕熱門比較容易,但如果注意力不被大流所驅(qū)趕,而在如1970年GFP研究狀態(tài)時加入這種領(lǐng)域,其實是很安全的重要課題,那時已經(jīng)知道有綠色蛋白,主要是提純。當(dāng)然,能做1961年的工作更好,不過那要求就高很多。

  

  下村的故事完了嗎?

  

  這個問題有兩個含義。一是下村修。二是他兒子下村務(wù)。

  年逾80的下村修,無疑應(yīng)該獲諾貝爾獎。但是他是否能得到,卻有較大疑問。首先諾貝爾獎委員會出錯頻率不低,近年也出過好幾次。其次,諾貝爾化學(xué)獎委員會有時橫炮打到生物里,或沒搞懂全貌、或只從化學(xué)出發(fā),把獎發(fā)給一個領(lǐng)域的某個人,而忽略了領(lǐng)域里其他人,甚至更重要的人。一類工作被獎后,其他獎的委員會一般不愿再給同類工作發(fā)獎,這樣造成一個領(lǐng)域最重要的人沒得獎,而其他人得獎。這種現(xiàn)象,在下村修身上發(fā)生的可能性不小。過去十年,發(fā)過好幾個與GFP相關(guān)的獎,都沒有下村修。只有很少幾個不出名的獎近年給下村修。他是否能得諾貝爾獎,反映的不是他的水平,而是諾貝爾獎委員會的水平;瘜W(xué)和生理兩個委員會,是否能比平時水平高一點,還得拭目以待。目前化學(xué)獎委員會打錯橫炮的機率并不是0。過去5年,化學(xué)獎委員會發(fā)生物相關(guān)的獎出過三次錯(近十年生理獎也出過錯,不過沒有化學(xué)獎頻率高)。人的評判無絕對客觀,諾貝爾獎委員會也不例外。

  下村修既無名也無利。他兒子下村務(wù)(Tsutomu Shimomura)卻很年青就成了名人。下村務(wù)是下村修1964年回日本期間出生于名古屋。后隨父母回美國,長于普林斯頓,上普林斯頓高中。在加州理工學(xué)院念大學(xué)時,跟過諾貝爾物理獎獲得者費曼(Richard Feynman)。曾任職于加州大學(xué)圣迭戈分校的物理系和圣迭戈超級計算中心。

  下村務(wù)90年代協(xié)助聯(lián)邦調(diào)查局抓住了一個有名的黑客,讓那人坐了牢。1995年,他和記者以此為基礎(chǔ)合寫一本書Takedown(中文“駭客追緝令”),書被改編成電影,很出名。有傳說他小時候有逆反心理,后來也可能是黑客,在國會作證時,有聯(lián)邦調(diào)查局探員在身旁,他也黑國會的通訊系統(tǒng)。

  所以,下村家的故事怎么落幕,還不清楚。

  

  “研三病”:對科學(xué)的幻滅和對科學(xué)家的悲觀失望

  

  以前,一些崇拜科學(xué)的人,常把科學(xué)家看得比實際更偉大。而得了諾貝爾獎的科學(xué)家,也有隱去實情,在得獎后大談對科學(xué)的熱愛, 刻意淡化自己對獲獎的重視。

  現(xiàn)在,做科學(xué)研究的人很多,認識科學(xué)工作者的人更多。人們發(fā)現(xiàn)科學(xué)界很多人并不崇高。原來一些得獎的人不僅熱衷于獲得認可,而且為了得獎去做很多學(xué)術(shù)政治,有的不斷和評選委員會拉關(guān)系,有的到評獎機構(gòu)蹲點“合作研究”,有的貶低其他人工作。還有些科學(xué)工作者做研究純粹為了利益,對學(xué)術(shù)不感興趣,甚至造假。諸如此類,不一而足。

  這樣導(dǎo)致了我稱之為的“研三病”:也就是一些水平相當(dāng)于研究生三年級的人,對科學(xué)研究和科學(xué)家群體非常悲觀,自認為看破科學(xué)界的紅塵,憤世嫉俗,走向反面,認定為好奇而做科學(xué)的人早已滅絕,斷言已經(jīng)沒有純粹為科學(xué)而科學(xué)的科學(xué)家。

  有些科學(xué)工作者一輩子都擺脫不了這種病,看不到科學(xué)的美,看不到科學(xué)家追求美的品味和探索真理的高尚,這不僅影響他們自己的科學(xué)研究、動力、動機,而且描黑整個科學(xué)界,甚至成為科學(xué)界的不良分子。

  我近年在一些學(xué)校和研究機構(gòu)講“科學(xué)研究的動力”,總結(jié)有三種:好奇、敬業(yè)和求勝。為了免疫青年學(xué)子,不犯“研三病”、或者較早緩解,我既說明確實很多科學(xué)家做科學(xué)的動力比較通俗,但也有科學(xué)家是好奇驅(qū)動。我希望通過下村修的故事,有助于犯“研三病”者明了每十年中生命科學(xué)都有幾項非常重要的、大家公認的發(fā)現(xiàn)和發(fā)明,從憂郁癥中覺悟過來,潛心尋求好的研究方向,自強不息。

  

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  2008年10月4日寫

  2008年10月5日《科學(xué)網(wǎng)》

  2008年10月6日《科學(xué)時報》發(fā)表

  

  饒毅,北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授,院長。

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