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基于DNA條形碼(ITS2)的中藥材防風(fēng)與其混偽品的鑒定

發(fā)布時(shí)間:2019-08-29 來源: 幽默笑話 點(diǎn)擊:

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  [摘要] 目的 通過ITS2序列分析,對防風(fēng)及其易混偽品進(jìn)行鑒定,確保用藥安全。 方法 從GenBank數(shù)據(jù)庫下載中藥材防風(fēng)與其混偽品的DNA條形碼ITS2序列,利用MEGA 6.06軟件進(jìn)行比對分析,計(jì)算GC含量及變異位點(diǎn)、種內(nèi)、種間遺傳距離,并構(gòu)建NJ系統(tǒng)發(fā)育樹,應(yīng)用ITS2數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站預(yù)測其ITS2二級結(jié)構(gòu)。 結(jié)果 序列分析與遺傳距離結(jié)果顯示,防風(fēng)與其混偽品存在明顯差異,基于ITS2序列的NJ樹及其ITS2二級結(jié)構(gòu)均可以將防風(fēng)與其混偽品進(jìn)行區(qū)分。 結(jié)論 ITS2能夠準(zhǔn)確鑒定防風(fēng)及其易混偽品,可用于中藥材的快速鑒別。
  [關(guān)鍵詞] 防風(fēng);DNA條形碼;混偽品;ITS2;分子鑒定
  [中圖分類號] R927 [文獻(xiàn)標(biāo)識碼] A [文章編號] 1674-4721(2016)05(c)-0004-04
  Identification of Saposhnikovia divaricata and its adulterants based on DNA barcode (ITS2)
  LIN Hao1 QIAN Jie-ying2 LI Si-lu3 OU Hui-hong1 XIA Hai-shan1,4 LIU Yong1,4▲
  1.School of Pharmac,Guangdong Medical University,Dongguan 523808,China;2.Department of Biochemistry and Molecular Biology,Guangxi Medical University,Nanning 530021,China;3.School of Basic Medicine,Guangdong Medical University,Dongguan 523808,China;4.Guangdong Key Laboratory for Research and Development of Natural Drugs,Zhanjiang 524023,China
  [Abstract] Objective To identify Saposhnikovia divaricata and its adulterants by using ITS2 sequence analysis and to secure medication safety. Methods ITS2 sequences of Saposhnikovia divaricata and its adulterants were downloaded from GenBank,MEGA 6.06 software was used for sequence analysis to summarize GC content,variation sites,estimate intra-and inter-specific genetic distances,and built NJ trees.Moreover,the secondary structure of ITS2 was predicted by using the ITS2 database websites. Results ITS2 sequence analysis and genetic distances calculation showed significant difference in the samples.Further more,NJ tree and secondary structure results could distinctly differentiate quality product and adulterants. Conclusion ITS2 can effectively identify Saposhnikovia divaricata and its adulterants,as a result,it can be used for rapid identification of Chinese medicinal materials.
  [Key words] Saposhnikovia divaricata;DNA barcoding;Adulterants;Internal transcribed spacer 2;Molecular identification
  防風(fēng)(Saposhnikovia divaricata)是雙子葉植物傘形科(Umbelliferae)多年生草本植物防風(fēng)屬(Saposhnikovia)防風(fēng)的干燥根[1],是常用的中藥材之一,主要產(chǎn)于我國北部和東北部,分布于東北、華北及陜西、寧夏、甘肅、山東等地[2]。防風(fēng)具有祛風(fēng)解表、除濕止痛、疏肝解痙、殺蟲止癢的功效,主治外感風(fēng)寒,頭痛項(xiàng)強(qiáng),目;铦,風(fēng)寒濕痹,骨節(jié)酸痛,腹痛泄瀉,腸風(fēng)下血,破傷中風(fēng),麻疹難透,風(fēng)疹瘙癢,瘡瘍初起。由于防風(fēng)的藥用價(jià)值高,市場需求極大。近年來,部分不法商人以川防風(fēng)、杏葉防風(fēng)、華中前胡、田葛縷子、硬阿魏、野蘿卜等冒充正品防風(fēng),影響了用藥療效及安全。傳統(tǒng)的防風(fēng)鑒定方法主要是從基原、性狀、顯微、理化等方面進(jìn)行區(qū)別[3-5],這些方法對操作人員的專業(yè)知識要求較高,具有一定的局限性,難以滿足中醫(yī)藥現(xiàn)代化發(fā)展的要求,因此,亟需建立一種簡單、快速、準(zhǔn)確的鑒定防風(fēng)藥材及其混偽品的方法。
  DNA條形碼[6](DNA barcoding)技術(shù)是用一段標(biāo)準(zhǔn)的、較短的DNA序列作為物種標(biāo)記的一種物種分子鑒定方法,可以對生物物種實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確、快速、簡便的鑒定。“DNA條形碼”首先由加拿大動(dòng)物學(xué)家、皇家學(xué)會(huì)會(huì)員Paul Hebert于2003年提出,是在分子分類學(xué)和DNA分類學(xué)的基礎(chǔ)上用單一的小片段基因作為物種的條形碼,進(jìn)而為整個(gè)生物界的物種編碼,達(dá)到類似超市利用商品條形碼可以快速準(zhǔn)確識別成千上萬種商品的效果[7]。

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