中藥材的種類很多，有種子類、花類、果實類、皮類、全草類等，每類藥材的加工都不一樣。
　　種子類藥材的加工 一般果實采收后直接曬干、脫粒、收集種子。有些藥材要去種皮或果皮，如薏苡、決明子等。有些要擊碎果核，取出種仁供藥用，如李仁、酸棗仁等。有些則要蒸，以破壞藥材易變質(zhì)變色的酵素，如五味子、女貞子等。
　　花類藥材的加工 為了保持花類藥材顏色鮮艷、花朵完整，采后應(yīng)放置在通風(fēng)處攤開陰干或在低溫下迅速烘干，以避免有效成分的散失，保持濃郁的香氣。如紅花、芫花、金銀花、玫瑰花、月季花等。極少數(shù)種類則需先蒸后再進行干燥，如杭白菊等。
　　果實類藥材的加工 一般果實類藥材采收后直接曬干或烘干即可。但果實大又不易干透的藥材，如佛手、酸橙、木瓜等應(yīng)先切開后干燥；以果肉或果皮入藥的藥材，如栝樓、陳皮、山茱萸等，應(yīng)先去除瓤、核或剝皮后干燥；此外，有極少數(shù)藥材如烏梅等還需經(jīng)烘烤、煙熏等方法加工。
　　皮類藥材的加工 一般采后趁鮮切成片或塊，再曬干即成。但有些種類在采收后應(yīng)趁鮮刮去外層的栓皮，再進行干燥，如丹皮、椿根皮、黃柏皮等；有些樹皮類藥材采后應(yīng)先用沸水略燙后，加碼疊放，使其“發(fā)汗”，待內(nèi)皮層變成緊褐色時，再蒸軟刮去栓皮，然后切成絲，片或卷成筒，再進行干燥，如肉桂、厚樸、杜仲等。
　　全草和葉類藥材的加工 采收后直接放在通風(fēng)處陰干或晾干，尤其是含芳香揮發(fā)油類成分的藥材，如薄荷、荊芥、藿香等忌曬，以避免有效成分損失：有些全草類藥材在未干透前就應(yīng)扎成小捆，再晾至全干，避免散失，如紫蘇、薄荷、斷血流等。一些含水量較高的肉質(zhì)葉類，如馬齒莧、垂盆草等應(yīng)先用沸水略燙后再進行干燥。
　　根及地下莖類藥材的加工 這類藥材采收后，一般須先洗凈泥土，除去須根、蘆頭和殘留枝葉等，再進行大小分級，趁鮮切成片、塊或段，然后曬干或烘干即成，如白芷、丹參、牛膝、前胡、射干等；一些肉質(zhì)性、含水量較高的塊根、鱗莖類藥材，如天冬、百部、薤白等，應(yīng)先用沸水稍燙一下，再切成片曬干或烘干；對于質(zhì)堅難以干燥的粗大根莖類藥材，如玄參、葛根等應(yīng)趁鮮切片，再進行干燥；對于干燥后難以去皮的藥材，如丹皮、桔梗、半夏、芍藥等應(yīng)趁鮮刮去栓皮；對那些含淀粉、漿汁足的藥材，如天麻、地黃、玉竹、黃精、何首烏等應(yīng)趁鮮蒸制，然后切片曬干。有些種類如北沙參、明黨參等應(yīng)先放入沸水中略燙一下，再進行刮皮、洗凈、干燥；此外，如丹參、玄參、白芍等藥材，先要經(jīng)沸水煮，再經(jīng)反復(fù)“發(fā)汗”才能完全干燥。還有些種類的藥材，如山藥、貝母等須用硫磺熏蒸才能較快干燥，保持色澤潔白，粉性足，且能消毒、殺蟲、防毒，有利于藥材的貯藏。

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