人生而平等 獨(dú)立宣言【文特爾,追逐基因的人生】
發(fā)布時(shí)間:2020-04-05 來源: 歷史回眸 點(diǎn)擊:
冒險(xiǎn)少年的蛻變 2010年5月20日,克萊格•文特爾(Craig Venter)宣布成功制造出人造細(xì)胞“辛西婭”,引起全球激辯,這個(gè)熱愛冒險(xiǎn)、擅于炒作的科學(xué)家,也走進(jìn)了公眾的視野。
文特爾認(rèn)為,他的成功很大程度上要?dú)w功于自己熱愛冒險(xiǎn)的天性――這點(diǎn)從小就顯現(xiàn)出來了。小時(shí)候,他家在鐵路的旁邊,鐵路成了他和伙伴們的冒險(xiǎn)場所。他們把硬幣扔到鐵路上,讓來往的火車把上面的數(shù)字壓平,或是在火車到來之前把耳朵放在鐵路上,比誰能堅(jiān)持最長的時(shí)間。到后來,他甚至嘗試著在火車司機(jī)的怒吼聲中扒上來往的車廂。
學(xué)習(xí)似乎不是他的強(qiáng)項(xiàng)。上高中時(shí),文特爾甚至在單詞拼寫上還存在困難。幸運(yùn)的是,在最后一門課程里,他寫了一篇熱情洋溢的支持共和黨候選人的文章,這讓持保守政治觀點(diǎn)的老師手下留情,給了一個(gè)D-,才順利畢業(yè)了。
因?yàn)橛斡咎亻L,亞利桑那州立大學(xué)給了他一份獎學(xué)金,教練也建議他朝職業(yè)運(yùn)動員的方向努力。但是,文特爾厭倦了這種循規(guī)蹈矩的生活,又因?yàn)閹ьI(lǐng)同學(xué)抗議學(xué)校受到懲罰,所以來到南加州,白天喝酒和沖浪,傍晚則在一間倉庫里幫忙給玩具貼上價(jià)格標(biāo)簽,掙點(diǎn)生活費(fèi)。
這個(gè)時(shí)候,美國正被卷入越南內(nèi)戰(zhàn)。時(shí)任總統(tǒng)約翰遜作出擴(kuò)大戰(zhàn)爭的決定后,越來越多的年輕人從舒適的美國鄉(xiāng)村來到了充滿死亡氣息的越南雨林。在猶豫之后,文特爾不顧父親反對,把長發(fā)剪掉,成為一名海軍士兵。
他的智商測驗(yàn)在新兵中名列第一,所以可以自由選擇軍隊(duì)里的工作。最后,他決定進(jìn)入海軍醫(yī)院,成為一名醫(yī)護(hù)兵。這一決定對他產(chǎn)生了深遠(yuǎn)的影響。在那里,文特爾見識了很多種疾病,也學(xué)會了諸如活體組織切片這樣的醫(yī)療技術(shù)。
殘酷的戰(zhàn)爭也讓他對世界產(chǎn)生懷疑,并決定用自殺來逃避這一切。文特爾計(jì)劃在大海里結(jié)束自己的生命。他從海灘出發(fā),向深海游去,準(zhǔn)備在筋疲力盡之后沉入海底。不過,他低估了自己的游泳技術(shù)和體力――游了一英里后,不僅沒有沉下去,反而開始懷疑起自殺的決定,所以,還是先游回去再說。
越南的經(jīng)歷讓文特爾迅速地成長起來,也改變了自己的性格。退役后回到加州,他決定繼續(xù)學(xué)業(yè),成了當(dāng)?shù)匾凰鐓^(qū)大學(xué)的學(xué)生,并連續(xù)3個(gè)學(xué)期獲得全A的成績,隨后轉(zhuǎn)入加州大學(xué)圣地亞哥分校。在一門課程里,為了完成書評作業(yè),他閱讀了生物學(xué)家詹姆斯•沃特森的自傳《雙螺旋》。沃特森介紹了自己和同事發(fā)現(xiàn)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的經(jīng)歷,這激發(fā)了文特爾對于基礎(chǔ)生物學(xué)研究的興趣,他開始師從酶學(xué)家Nathan O.Kaplan進(jìn)行生物化學(xué)研究,并獲得博士學(xué)位。
人類基因組測序之爭
我們幾乎全部的遺傳信息都保存在基因組里。如果把基因組比作一本書的話,那人類的性別性向、眼睛的顏色、智力等可以遺傳的形狀都被寫在這本書里。這本書一共只有4個(gè)字母,分別對應(yīng)4種不同的化學(xué)物質(zhì)。如果可以知道基因組的序列,或是知道這本遺傳之書的全部內(nèi)容,就會幫助理解生命的本質(zhì)。
英國生化學(xué)家弗雷德里克•桑格首先發(fā)明了霰彈槍定序法。這種方法可以把完整的基因組打成很多小片段,分別對每個(gè)小片段進(jìn)行測序,然后再把這些片段的序列按照一定的算法拼接起來。此后,加州理工學(xué)院的胡德又發(fā)明了自動測序法。隨著一些簡單生物的基因序列被測出來,科學(xué)家開始討論對人類基因組進(jìn)行測序的可能性。
胡德的文章引起了文特爾的興趣。他說服上司買了一臺可以用來進(jìn)行自動測序的儀器。這時(shí)候,詹姆斯•沃特森也來到國立衛(wèi)生研究院,成為他的上司。
1990年左右,文特爾的研究取得重要突破。在人的基因組里,絕大部分序列并不被編碼,這些不編碼的區(qū)域占了基因組的95%-98%,又被稱為“垃圾基因”(最近幾年的研究發(fā)現(xiàn),垃圾基因也存在生物學(xué)功能),而文特爾認(rèn)為,與其測出所有基因組序列,還不如挑出那些確定可以編碼的基因,這樣不僅可以加快速度,還可能發(fā)現(xiàn)新的基因。
這種新技術(shù)簡稱EST,在EST的幫助下,文特爾發(fā)現(xiàn)了大量新的基因。這時(shí)他作出了一個(gè)決定:準(zhǔn)備給自己發(fā)現(xiàn)的這些新基因申請專利。不過,沃特森等人強(qiáng)烈反對利用科學(xué)發(fā)現(xiàn)申請專利。
專利申請失敗讓文特爾和沃特森的關(guān)系進(jìn)一步惡化,最終他決定離開,并獲得7000萬美元的風(fēng)投,成為一家獨(dú)立基因組研究所的領(lǐng)導(dǎo)人。在這里,他和同事改進(jìn)了霰彈槍定序法,成功地對多種微生物進(jìn)行了測序。不過,研究所和資助方不斷產(chǎn)生矛盾,最終決定脫離資助方。因?yàn)檠芯克^去良好的聲譽(yù),文特爾很輕松地又籌集到了資金,并創(chuàng)立了一個(gè)新的機(jī)構(gòu):塞雷拉基因組公司。
在塞雷拉基因組公司,文特爾將注意力轉(zhuǎn)移到了人類的基因組測序。人類的基因組比之前測序的微生物的基因組要大得多,大約有60億個(gè)字母。1990年,美國能源部和國立衛(wèi)生研究院投資30億美元,開始了人類基因組計(jì)劃,領(lǐng)導(dǎo)人是分子生物學(xué)家弗蘭西斯•柯林斯。
不同的實(shí)驗(yàn)室和科學(xué)家都想從政府的巨額資助里分一杯羹,因此展開了明爭暗斗。在測序方法上,柯林斯堅(jiān)持使用準(zhǔn)確度高、但進(jìn)展較慢的桑格測序法;此外,基因組計(jì)劃牽涉了太多的科學(xué)家和獨(dú)立實(shí)驗(yàn)室,協(xié)調(diào)很不方便,進(jìn)展很慢。文特爾就不一樣,他堅(jiān)持使用速度快但準(zhǔn)確率不高的霰彈槍定序法,同時(shí),利用計(jì)算機(jī)發(fā)展出了相對成熟的拼接算法來彌補(bǔ)霰彈槍定序法的缺點(diǎn)。很快,他們的進(jìn)展就把整個(gè)基因組計(jì)劃甩在了后面。
文特爾公開表示,自己的公司會在2000年左右完成計(jì)劃,并會為測出的基因申請專利。這個(gè)決定引起了軒然大波。如果計(jì)劃實(shí)現(xiàn)了,以后無論是科學(xué)家研究某個(gè)基因或是普通人希望了解自己的基因序列,都要給塞雷拉公司支付費(fèi)用。支持者認(rèn)為,申請專利可以保護(hù)科學(xué)家的勞動成果,鼓勵創(chuàng)新;而反對者則認(rèn)為,科學(xué)研究的精髓在于通過論文公開所有的研究結(jié)果,這樣才能更好地交流。
這個(gè)決定顯然不能被柯林斯接受,最后,在克林頓的調(diào)解下,文特爾同意和人類基因組計(jì)劃合作,并在完成測序工作以后的同一時(shí)間宣布結(jié)果,把所有數(shù)據(jù)公開放到數(shù)據(jù)庫里,提供免費(fèi)下載。
2000年6月26日,包括文特爾在內(nèi)的幾位基因組科學(xué)家以及美國總統(tǒng)克林頓、英國首相布萊爾在白宮宣布人類基因組草圖完成。文特爾作了一次漂亮的演講,他說:“有些人告訴我,對人類的基因組進(jìn)行測序會損失人性,因?yàn)樯鼘⒉辉俅嬖诿孛。詩人們則認(rèn)為基因組測序是對整個(gè)世界徹底的還原,因此會剝奪他們的靈感。不過事實(shí)正好相反,復(fù)雜而沒有生命的化學(xué)物質(zhì)可以構(gòu)成我們的遺傳密碼,這是如此的奇妙,更能體現(xiàn)人類的精神,足以讓哲學(xué)家和詩人們感嘆一千年!
合成基因組
在過去幾十年里,文特爾一直在嘗試“閱讀”基因之書。而在經(jīng)歷了被迫離開塞雷拉公司又東山再起之后,他希望更進(jìn)一步,不僅能“讀”,還要會寫,于是開始致力于合成基因組的研究。
文特爾選中了蕈狀支原體,先合成出和病毒基因組大小相仿的片段,再組裝合成完整的基因組。然后,把人工合成的蕈狀支原體基因組轉(zhuǎn)移到另外一種細(xì)菌山羊支原體中。再除去山羊支原體里原有的基因,這樣就得到一個(gè)全新的細(xì)胞:山羊支原體的細(xì)胞質(zhì)和蕈狀支原體的基因組。
在新合成的基因組里,文特爾加了4個(gè)水印,包括了所有研究人員的姓名。在新的細(xì)胞里,他們清楚地看到了這4個(gè)水印,這說明實(shí)驗(yàn)成功了。
這項(xiàng)研究引起了巨大轟動。很多新聞都以“合成生命”作為標(biāo)題。不過這離真正的合成生命還有很大的距離,想真正地合成生命,還需要對生命規(guī)律有更加深入的了解。如同一個(gè)不識字的孩子,也能照葫蘆畫瓢地抄出一本書,但如果對書中語言的語法和文字沒有基本的了解,是不會理解其內(nèi)容的。
理解基因組,正是文特爾下一步的研究內(nèi)容。他把自己的帆船改成了一艘實(shí)驗(yàn)船,在大海里尋找形形色色的新生命和新基因。他發(fā)現(xiàn)很多海洋微生物可以把二氧化碳轉(zhuǎn)化為甲烷,因此決定展開新的研究,合成出可以在消耗二氧化碳的同時(shí)產(chǎn)生能源的新細(xì)胞。也許這位充滿個(gè)性的科學(xué)家會在全球暖化和能源問題上給世界一個(gè)驚喜。
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