對方舟子下任何簡單的定論都是草率的。 　　數(shù)年來，他和他的“新語絲”網(wǎng)站，像揭開皇帝新裝的那個孩子，一次次捅破知識界的剽竊與欺騙，一而再挑戰(zhàn)學術權威和商業(yè)神話�！皼]有方舟子，中國學術腐敗將比現(xiàn)在嚴重得多�！边@是他的一個“論敵”對他的評價。今年4月8日，在云南大學的演講，標志著“學術打假人”方舟子開始參與到更大范圍的社會事務中。
　　他觸動了太多人的利益，壞了很多人的好事。他熱衷于打破他認定的迷信，他毫不留情地將那種在他眼里只是一堆垃圾的光環(huán)扯得粉碎；
　　他的極富攻擊性的“惡毒”的修辭方式令很多人不愿與他正面交鋒；
　　他傲慢地轉過身去，背對著那些他認為“不夠資格”與他爭辯的對手；
　　他得罪了很多人，惹了不少筆墨官司，遭到了大規(guī)模的反對和攻擊；
　　他贏得了“斗士”的美名，也背上了“瘋狗”、 “文革遺風”、“精神分裂”的惡名。
　　有一幅漫畫是這樣的，前面一大群人在落荒而逃，后面是方舟子和洪水在追趕――題目是“方舟子來了”。
　　我們集體地習慣于邀請國際上的權威人士來給我們的方方面面號脈、開藥方，也集體地習慣于向方舟子這樣的另類投去“這是何方神圣”的狐疑目光；
　　我們沒有一個制度來監(jiān)督我們的泥沙俱下、百病叢生的學術。在方舟子之前，我們也沒有多少單槍匹馬的“冷面殺手”來警示那些堂而皇之地騙取聲名和金錢的學術騙子。從這一點來說，方舟子無疑有其積極的和正面的意義。
　　在一些與他有過爭端的學者的眼里，方舟子的形象與他自我認定的光輝形象有著諷刺性的差距。有人說，方舟子的慣用手法是迅速將話題意識形態(tài)化，把持有不同意見的人說成是“反科學，反政府、反人類、用心險惡”，“如果你批評他的打假缺少程序正義，他就會說你擁護學術腐敗”。
　　在我們的記者用素描的手法對他進行了個性化的描繪之后，他認定我們的記者是在用歪曲、捏造、臆斷等“文革手法”對他進行污蔑。
　　我們呈現(xiàn)“方舟子現(xiàn)象”的各方觀察、解讀，并把評判留給每一位讀者和這個越來越理性健康的時代。
　　我們希望，很多年后，在人們已經不再計較方舟子的性格上的偏激偏執(zhí)偏頗和他向無辜者潑出的“惡語”的時候，人們依然可以記得，那是一個在沉默的大多數(shù)保持沉默的年代向學術腐敗勇敢地、惡狠狠地挑戰(zhàn)的勇士。
　　
　　方舟子戰(zhàn)事
　　
　　1994年2月，創(chuàng)辦世界第一份中文網(wǎng)絡創(chuàng)作類電子雜志“新語絲”。
　　1995年6月，建立國際上最早的中文電子文庫之一“新語絲電子文庫”。
　　2000年3月，“新語絲”設立“立此存照”專欄，成為中文網(wǎng)絡第一個學術打假網(wǎng)站。至今揭發(fā)50多個“假學術”、“假文憑”和學者抄襲剽竊案例。影響較大的有“哈佛最年輕的教授”夏建統(tǒng)事件、“基因皇后”陳曉寧事件、“北航抄襲事件”、吳征假文憑事件、楊雄里院士抄襲事件、王銘銘剽竊事件、汪丁丁事件、清華“十面博士”董關鵬事件、朱蘇力招生事件、薛涌事件等等。
　　2000年6月，出版的《方舟在線》一書，是“國內第一部多學科網(wǎng)上爭鳴文集”，引起轟動，獲“2000年《Newton-科學世界》杯十大科普好書獎”。
　　2000年8－9月間，“新語絲”揭發(fā)“基因皇后”陳曉寧事件。
　　2001年1月，揭露“核酸營養(yǎng)”騙局。
　　2002年4月，與國內基督教人士產生極大分歧，最著名的是針對丁林的批判。
　　2002年4月，至今未平的“克隆人論戰(zhàn)”。方認為，在技術條件成熟的前提下，“并沒有一種能經得起推敲的理由禁止克隆人”。
　　2002年8月，批判“偽納米”技術。
　　2002年9月，對朱海軍等“民間科學家”的系列批判。
　　2002年11月，方批判北大“科學傳播中心”是“反科學傳播中心”，矛頭直指北大科學傳播中心吳國盛、劉兵、劉華杰、田松等人。
　　2003年2月，發(fā)布“中醫(yī)騙子論”。把中醫(yī)視為“騙子”，從“龍膽瀉肝丸”事件到發(fā)表《艾滋病拯救得了中醫(yī)嗎？》，為此與中醫(yī)界人士論戰(zhàn)不止。
　　2005年3月，“轉基因事件”。就“轉基因”產品是否對人類有害，與《中國青年報》記者劉縣書展開論戰(zhàn)。
　　2005年4月，云南大學演講，直擊“偽環(huán)保”人士。早前和環(huán)保人士展開“應否敬畏自然”大爭論，方舟子堅持“人類無須敬畏自然”。

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