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共四所：
東京大學(xué)24、
北京大學(xué)39、
京都大學(xué)60、
清華大學(xué)67。

按照上述排名，在全球大學(xué)前100名中，中日兩國高校雖然都是入選兩校，但日本兩所大學(xué)的名次比北大、清華名次更加考前。
而另一個2013年的排名是：

2013年亞洲前20名最佳大學(xué)名單及排名變化
第一名：香港科技大學(xué)
第二名：新加坡國立大學(xué)與香港大學(xué)并列
第四名：國立首爾大學(xué)
第五名：（中國）北京大學(xué)(上升1名)
第六名：韓國科學(xué)技術(shù)院(上升1名)
第七名：韓國浦項科技大學(xué)與香港中文大學(xué)并列
第九名：（日本）東京大學(xué)(下跌1名)
第十名：（日本）京都大學(xué)與新加坡南洋理工大學(xué)并列
第十二名：香港城市大學(xué)
第十三名：（日本）東京工業(yè)大學(xué)
第十四名：（中國）清華大學(xué)(上升1名)
第十五名：（日本）大阪大學(xué)(下跌4名)
第十六名：韓國延世大學(xué)
第十七名：（日本）東北大學(xué)(下跌3名)
第十八名：（日本）名古屋大學(xué)(下跌4名)
第十九名：高麗大學(xué)(上升2名)
第二十名：（日本）九州島大學(xué)(上升2名)。

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